目前《中国学术期刊（网络版）》的新型数字出版模式有5种，既包括传统印刷版学术论文的单篇网络首发、单篇或整期形式的优先出版，又包括具有内部及外部链接功能、依赖于互联网络发布的学术论文增强数字出版，还有数据论文出版，以及作者无排名次序的协同创新出版。

与仅把印刷版期刊的数字化发布不同，新型出版模式出版的内容发布时以HTML（Hyper Text Markup Language超文本标记语言，简称HTML）在网络上呈现给读者。读者既能及早发现最新的文献情报，亦可对所提供的数据进行深度钻研和再利用。引用时请标注DOI（Digital Object Identifier数字对象标识符，以下简称DOI）以便保持引用的准确性。

单篇网络首发是指借助互联网（含移动网络）在“中国知网”以数字出版方式优先出版学术期刊的单篇论文内容。按照首发时的编辑状态，通常可分为3种：录用定稿、排版定稿、整期定稿。

录用定稿指某刊内容确定、通过同行评议、主编终审同意刊用的稿件。

排版定稿是指录用定稿按照期刊特定版式（包括网络呈现版式）排版后的稿件，内容和版式确定，可能没有出版年、卷、期、页码。

整期定稿指出版年、卷、期、页码已确定的印刷或数字出版的整期汇编稿件。

优先出版指学术期刊优先于印刷版纸刊发行、以单篇或整期发布的方式，在“中国知网”借助互联网（含移动网络）数字出版，完整呈现论文所有内容。

增强出版包含根文献和附加内容，经过组织和封装，形成一个有内在联系的复合数字作品的数字出版物，是全部学术成果的出版。其中，根出版物指与印刷版出版物内容一致的数字化出版物形式，或者并无印刷版相对应的纯粹数字化出版物；附加内容又叫增强材料，伴随根文献一起进行数字化出版，其内容包括文本、数据表格、图像、音频、视频、软件程序、手稿等，通常仅通过网络呈现。

数据出版是指在互联网用出版的方式来发布数据。目前，以数据论文和数据集的方式实现数据出版。数据论文是通过网络在线方式出版的一种学术出版物，主要提供学术数据以及相关的信息，包括数据的采集、处理和分析方法等，但不一定提供科学结论。数据论文稿件由描述文档、数据集（或者数据集存储地址）、数据集元数据构成。